כשהיה בן שתים-עשרה נתלש יחיאל חנוך מסמטאות ילדותו בשכונת נחלת ציון בירושלים ומתנתק מערכי התרבות והרוח שעליהם גדל ונתחנך. מאותו הרגע הוא חווה קרעים נפשיים המאיימים לפרק את זהותו. ככל שהולכת ונרקמת אישיותו הרוחנית והאינטלקטואלית, משתרשת בנפשו תחושת האפסות והחידלון. באביב ימיו, לאחר שגדל להיות מרצה צעיר לקבלה באוניברסיטה העברית ולכאורה מצא יתדות לנטוע בהן את אוהלו המשפחתי ואת ביתו הרוחני והאינטלקטואלי, ניצב ד"ר יחיאל חנוך על פי תהום. בערב יום הכיפורים פורצת אל חייו אישה צעירה המסעירה את נפשו ומערערת מחדש את תמונת עולמו.

כעץ שתול הוא רומן השואב השראה רבה מן הלשון ומן הסמלים של הקבלה. עלילה רבת תמורות ותהפוכות מזמינה את הקורא להציץ אל שכונותיה הישנות של ירושלים, אל מסתריה וניחוחותיה. מתחת לכנפי השכינה של העיר הקדושה נחשפות דמויות אנושיות פצועות וכואבות, המציבות סימני שאלה נוקבים באשר למהות החיים ומשמעותם. בספר זה מעמיד שוקק למבחן מחודש את היחס בין נתיבי האמונה והכפירה, החטא והתשובה, ובעיקר את שאלת אפשרות תיקון האדם, המשתומם על מציאות חייו נוכח חידת הקיום האנושי.