כיוון שלא היה בכוחו של יונאס פאולאוויציוס הליטאי להציל את כל היהודים, הוא החליט להציל את רוחו של העם היהודי. כך התהוותה בביתו ובמסתורים שהכין, כאין תיבת נוח ובה מהנדס יהודי, רופאים יהודיים ונער בן ארבע עשרה עם כינור. סביב מוקד זה נרקם סיפורו האוטוביוגרפי המצמרר של יוחנן פיין, נער עם כינור, המספר את קורותיו, קורות משפחתו, סיפור גבורתה של משפחת פאולאוויצ´יוס, אשר דבר לא הניא אותה ממאמציה להציל יהודים רבים ככל האפשר, ודמויות אותנטיות של היהודים ולא יהודים כאחד, שיוחנן הנער היה עד לגורלם.
הספר נקרא כסיפור עדות וכרומן סוחף ומרתק, המתרחש בעיצומה של מלחמת העולם השנייה, ונע על פני גטו קובנה, מקומות מסתור, תלאות ונדודים, עד בואו של המספר לחופי הארץ, בה פסק המרדף.

ביכולת התבוננות מפוכחת ושקולה, בחסכנות מופתית מדהימה במידת האיזון וההתאפקות, מיטיב פיין לספר את פלא הישרדותו. הוא פורש יריעה קיומית רבת תהפוכות ופסיפס אנושי של דמויות, הנחרטות בזיכרון המאבק הבלתי נלאה נגד האכזריות והזוועה בשיא גילומן הגהינומי. מעשים נדירים באנושיותם, מציעים לקורא ניסיון להבנת עמידתו של האדם במחיצת הרוע, והיאחזות במידת החסד, הרחמים והחמלה, המועצמים על רקע עולם הולך ומתפרק ומערכיו האנושיים.

"האם אין הסיפורים הללו מתחילים לחזור על עצמם? .. שוב נער יהודי עם כינור, שוב קול הלמות מגפי קלגסים, שוב מוות ויגון. אבל הספר הזה ניצח אותי, נשביתי בכבליו ונסחפתי", מעיד המבקר ההולנדי - John Jansen Van Galen עם צאת הספר לאור בהולנד, "נסעתי ברכבת והייתי שקוע כל כך בספרו של פיין, עד כי החמצתי את תחנת היעד שלי".