ספרי הלימוד של יד בן-צבי נכתבו כדי לענות על הצורך בלימוד התנ"ך בתפיסה אינטגרטיבית. התנ"ך יכול להוות עמוד השדרה של תוכנית הלימודים, סביבו אפשר ללמוד- גיאוגרפיה, ספרות, טבע, לשון לדון בשאלות של אתיקה וזיכרון.

שפע החומר שיש בספר נועד לגרות את התלמידים ולקשור את תקופת המקרא הרחוקה לארץ-ישראל ולעם ישראל, שאותם מכירים התלמידים טוב יותר. המורים יכולים לבחור את נושאי ההרחבה וההדגשים, מתוך ההיכרות עם התלמידים.
כל ספר מורכב משלושה חלקים:

הראשון עוסק במבוא כללי ללימודי ההיסטוריה ולתולדות ישראל.

החלק השני הינו לפי פרקי הלימוד של הספר על-פי תכנית הלימודים. הפרק מתמקד בהסבר התוכן, ההקשרים ההיסטוריים, הגיאוגרפיים והארכיאולוגיים. להסברים נלווים פירושי מילים, מפות, תמונות ופעילויות מגוונות לתלמיד.

הפרק השלישי הוא הרחבה לחלק השני. נושאי ההרחבה ילבנו נושאים בהקשר אקטואלי באמצעות סיפורים ופרקי מידע.

לימוד ברוח זה עשוי לתרום לרלוונטיות של סיפורי המקרא, לעולמם של התלמידים, לפתח את כישוריהם האינטלקטואליים ולהעשיר את חייהם הרגשיים, הערכיים והתרבותיים.